本校創立於民國四十二年，由北埔、峨眉、寶山三鄉熱心教育人士創校公推姜阿新先生 為建校主任委員，三鄉鄉長為副主任委員，勘定現址，積極籌劃，九月十一日奉准成立，初名為新竹縣立竹東中學北埔分部，李梅山先生為主任，十一月舉行落成暨開學典禮。
民國四十五年奉准名為新竹縣立北埔初級中學，遴派姜炫達先生為首任校長。
民國五十七年八月實施九年國民義務教育，改制為新竹縣立北埔國民中學。
歷任校長:
第一任校長:姜炫達先生(民42-60年)
第二任校長:劉喦鉅先生(民60-71年)
第三任校長:張金隆先生(民71-77年)
第四任校長:林礽麒先生(民77-78年)
第五任校長:洪賢明先生(民78-81年)
代理校長:鄭飄先生(民81-82年)
第六任校長:彭鏡洲先生(民82-87年)
第七任校長:林峰洹先生(民87-89年)
第八任校長:張竹秀女士(民89-94年)
第九任校長:彭紹彩先生(民94-99年)
代理校長:黃秀菊女士(民99-100年)
第十任校長:鄭光慶先生(民100-102年)
代理校長:張英杰先生(民102-103年)
第十一任校長:廖雪華女士(民103-111年)
第十二任校長:巫季烈先生(民111年-迄今)
本校自創校迄今邁入第七十年，在歷任校長悉心籌畫、銳意經營及全體教職員共同努力下，進行校舍整修、重建，重視學生品格教育及學生多元學習智力，以自發、互動、共好的教學模式提升學生學習風氣，奠定了學校發展基礎，樹立了優良校風。